Иван Иванович Мигунов руководил Одесской Городской Думой с 1803 по 1806 год. За его правление в 1804 году, по Указу императора от 19 февраля, в Одессе был учрежден специальный Строительный комитет, под председательством Дюка де-Ришелье, в который входил и городской голова. Наиболее важные функции по хозяйству города перешли к этому комитету: «постройка домов для чиновников, ремонт городских строений, наем квартир для разных чиновников, ремонт дорог, контроль строительства».

В 1800 году на должность генерал-губернатора Новороссийского края назначен генерал-аншеф Иван Иванович Михельсон - внук капитана шведской службы Иоганна, убитого в сражении под Полтавой. Сын полковника русской службы Ивана Ивановича.

С вступлением на Российский престол Александра I ситуация в Империи меняется. В манифест от 2 апреля 1801 года он говорит: «Мы признали за благо утвердить и восстановить Городовое положение и Грамоту, городам данную, во всей силе ее и пространстве, торжественно утверждая, и повелевая всем нашим верным подданным признавать Положение сие одним из главных, непреложных и неприкосновенных государственных установлений…».

30 ноября 1797 года генерал-губернатором края стал Михаил Васильевич Каховский, граф - генерал от инфантерии (1734 - 1800). Воспитывался в сухопутном шляхетском корпусе; принимал участие в семилетней войне и в первой при Екатерине II войне против турок. В 1783 г. Каховский командовал отдельным корпусом в Крыму, в 1784 г. назначен командующим Таврической областью.

С вступлением на престол Императора Павла Петровича Городское положение 1785 года введенное Указом Екатерины II, согласно которому в городах образовывались Общие городские думы под председательством городского головы, прекращает свое существование. 

В 1796 году после графа Зубова военным и гражданским губернатором назначен генерал-лейтенант Николай Михайлович Бердяев. На этой должности он служил до 30 ноября 1797 года. 

21 апреля 1785 года Екатерина II обнародовала знаменитую «Жалованную грамоту» громадам, благодаря которой на Руси создавалось Городское общество, как юридическое лицо, с определенными правами и обязанностями, и Городские Думы, выдающие все, что для этого общества «потребно, выгодно и полезно».